Cơ cấu tổ chức của Trung tâm bao gồm:
- Giám đốc và các Phó Giám đốc.
- Văn phòng Trung tâm.
- Phòng Quản lý đào tạo.
- Phòng Tư vấn và Hỗ trợ người học.
- Phòng Phát triển nội dung và chương trình đào tạo.
- Phòng Truyền thông và Marketing.
- Phòng Hợp tác phát triển.
- Phòng Công nghệ và Dữ liệu.
- Phòng Kế hoạch - Tài chính.
